A 5ª Companhia Independente de Polícia Militar, com sede no município de São Sebastião do Caí, teve sua denominação e nível organizacional definidos a partir da edição da Lei Complementar nº 16.450, de 24 de dezembro de 2025, a qual alterou o nível do então 27º Batalhão de Polícia Militar, transformando-o em Companhia Independente de Polícia Militar. A partir dessa data, a Unidade passou a denominar-se 5ª Companhia Independente de Polícia Militar, mantendo a continuidade de sua missão institucional e de sua área de atuação.

A atual 5ª CIA IND tem como origem histórica o 27º Batalhão de Polícia Militar, criado pelo Decreto Estadual nº 42.852, de dezembro de 2004, e pela Portaria nº 25/DA/2004, de 17 de dezembro de 2004, data em que a então Companhia de São Sebastião do Caí foi elevada à condição de Batalhão. À época, constituiu-se como órgão de execução da Polícia Ostensiva da Brigada Militar, responsável pelo policiamento ostensivo nos municípios de São José do Hortêncio, Harmonia, Tupandi, Bom Princípio, São Vendelino, Feliz, Vale Real, Linha Nova, Alto Feliz e São Sebastião do Caí, abrangendo uma área de ação composta por dez municípios.

A sede do então 27º BPM foi oficialmente instalada no município de São Sebastião do Caí em 17 de dezembro de 2004, na Rua São Lourenço, nº 1.097, por ocasião de sua transferência do município de Santo Ângelo, por ato do Comandante-Geral da Corporação. Ao longo de sua trajetória, a Unidade destacou-se pela atuação em grandes eventos regionais, exercendo de forma contínua suas funções constitucionais de Polícia Ostensiva e Preservação da Ordem Pública.

Por meio do Decreto nº 45.013, de 23 de abril de 2007, foi instituído como Patrono da Unidade o Coronel PM Sumerval Silveira.

Seu primeiro Comandante foi o Major QOEM José de Jesus Cirne da Silva, conforme publicação no Diário Oficial do Estado nº 249, de 31 de dezembro de 2004.